書いてあった。
配送指示（置き配含む） - Amazonカスタマーサービス

「配送可能時間」「置き配指定」「お届け先／置き配場所の目印、アクセス方法」はAmazonドライバーが配達する商品にのみ適用されます。

ウチの地域ではヤマト運輸の配送になるので、設定しても意味なかったんだねぇ。
ヤマト運輸なので後から変更できるから、いいっちゃいいんだけど。